科学研究

       2024年4月22日，数学与统计学院第6期“九章学术沙龙”成功举办。此次沙龙邀请了北京大学周沛劼助理教授作了题目为“Dynamical system approaches for single-cell transcriptomics data analysis”的，30余位师生参与并讨论，本次报告由裴斌教授主持。

      周沛劼从单细胞测序技术的基本概念入手，详细介绍了其背景、应用、研究现状与挑战。由于维数灾难，使用动态系统模型分析高维静态单细胞 RNA 测序 (scRNA-seq) 数据具有挑战性。周沛劼介绍了低维动态流形来识别快照数据中的吸引子盆地和转移概率，同时使用非平衡动力系统理论来分析吸引子稳定性并识别基因表达和上皮间质转变 (EMT) 剪接过程中的转变驱动基因。最后，周沛劼介绍了有关构建time-varying landscape的工作，使用 Wasserstein-Fisher-Rao 度量、不平衡最优传输及其基于神经网络的偏微分方程实现对非平稳时间序列 scRNA-seq 数据进行插值，以揭示 EMT 中间状态的干性等最新的研究成果。

      报告结束后，参会师生与周沛劼进行了深入的交流和讨论。通过这次报告交流，师生们都受益匪浅，不仅对单细胞测序技术有了相关的了解，也对未来的研究方向和应用前景有了更为清晰的认识。学院将持续加强有组织科研能级，营造积极活跃的学术交流氛围，进一步推进学院科技工作高质量发展。

      个人简介

      周沛劼，北京大学前沿交叉学科研究院国际机器学习研究中心老师，2010-2019年就读于北大数学学院计算数学专业，获得学士和博士学位，师从李铁军教授。毕业后在UC Irvine做博士后研究，任访问老师，合作导师Qing Nie。研究兴趣为数据驱动的计算系统生物学。

文：郭丽欣，赵倩/图：郭丽欣/审核：都琳